산업용이나 가정용으로 사용되는 대부분의 화학물질이나 소재들은 석유기반공정으로 생산된다. 따라서 세계적으로 많은 연구기관들이 이들을 대체할 수 있는 바이오 케미컬이나 바이오 소재 개발 연구에 박차를 가하고 있다. 미세조류의 바이오매스의 모든 구성 성분 (탄수화물, 지질,단백질)은 이러한 물질들을 생산할 수 있는 기초 구성요소로 사용될 수 있다. 특히 미세조류당화 공정을 통하여 얻는 당이나 미세조류가 생산하는 다양한 부가가치제품은 아래와 같이 여러 종류의 바이오케미컬이나 바이오 소재를 생산할때 사용될 수 있다.

• 3-HP
• 2,3-BDO
• Fucosyllacose
• PUFA (EPA, DHA)